機能性疾患として、甲状腺ホルモンが亢進するバセドウ病、亜急性甲状腺炎、無痛性甲状腺炎などや、甲状腺ホルモンが低下する橋本病などがあります。また器質的疾患として、甲状腺腫瘍（良性、悪性、その他、分類不能、腫瘍様病変）があります。